サンフランシスコ音楽院は1917年、エイダ・クレメントとリリアン・ホッジヘッドがエイダ・クレメント・ピアノ・スクールを設立し、1923年にサンフランシスコ音楽院として法人化しました。1926年にカリフォルニア弦楽四重奏団を迎え、その後移転しました。1960年には西海岸で初めて西部学校大学協会と全米音楽学校協会から認定を受けました。そして、1966年にミルトン・サルキンドが学長に就任し、入学者数が急増しました。コミュニティサービスプログラムを開始し、マスタークラスを拡大して多くの著名アーティストを招きました。そして、SFCMはクラシックギターの学位と室内楽の修士号を授与する国内初の機関の一つとなりました。2006年にはシビックセンターキャンパスに移転し、上海音楽院との国際室内楽フェスティバルを実現し、2021年には施設を追加、学生用住宅やリハーサル室、パフォーマンススペースを含む「垂直キャンパス」を開設しました。学生は、このような環境下で音楽を学び、創作、共有ができます。